债务已偿还但对方称借条遗失，如今却用借条提

起诉后借条丢了的处理办法：1、当事人可以进行起诉的，前提是有证据，并且在诉讼时效以内。2、证据包括录音、付款凭证等都可以，或者有证人见证的，都可以采用。3、法院判决后，如果对方不还可以申请法院强制执行，对债务人恶意拖欠的还可以拘留。债务人去世的，可以从其遗产中进行清偿。
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对于超过诉讼时效期间的民间借贷，当事人双方就原债务达成还款协议，或者借款人在催款通知单上签章，就视为对原债务的重新确认，该债权债务关系应受法律保护。
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对于债务问题，如果调解不成，您可以持借条或借款合同、证人证言等相关证据向法院起诉。